.gitignore
README.md
example_secrets.ini
open_s3.md
pyproject.toml
requirements.txt
setup.cfg
src/__init__.py
src/great_ai/__init__.py
src/great_ai/great_ai/__init__.py
src/great_ai/great_ai/context/__init__.py
src/great_ai/great_ai/context/context.py
src/great_ai/great_ai/context/get_context.py
src/great_ai/great_ai/deploy/__init__.py
src/great_ai/great_ai/deploy/create_fastapi_app.py
src/great_ai/great_ai/deploy/process_batch.py
src/great_ai/great_ai/deploy/process_single.py
src/great_ai/great_ai/deploy/serve.py
src/great_ai/great_ai/exceptions/__init__.py
src/great_ai/great_ai/exceptions/argument_validation_error.py
src/great_ai/great_ai/helper/__init__.py
src/great_ai/great_ai/helper/get_args.py
src/great_ai/great_ai/helper/snake_case_to_text.py
src/great_ai/great_ai/helper/text_to_hex_color.py
src/great_ai/great_ai/metrics/__init__.py
src/great_ai/great_ai/metrics/create_dash_app.py
src/great_ai/great_ai/metrics/get_description.py
src/great_ai/great_ai/metrics/get_filter_from_datatable.py
src/great_ai/great_ai/metrics/get_footer.py
src/great_ai/great_ai/metrics/log_argument.py
src/great_ai/great_ai/metrics/log_metric.py
src/great_ai/great_ai/metrics/assets/github.png
src/great_ai/great_ai/metrics/assets/index.css
src/great_ai/great_ai/models/__init__.py
src/great_ai/great_ai/models/load_model.py
src/great_ai/great_ai/models/save_model.py
src/great_ai/great_ai/models/use_model.py
src/great_ai/great_ai/persistence/__init__.py
src/great_ai/great_ai/persistence/mongodb_driver.py
src/great_ai/great_ai/persistence/parallel_tinydb_driver.py
src/great_ai/great_ai/persistence/persistence_driver.py
src/great_ai/great_ai/tracing/__init__.py
src/great_ai/great_ai/tracing/tracing_context.py
src/great_ai/great_ai/views/__init__.py
src/great_ai/great_ai/views/filter.py
src/great_ai/great_ai/views/health_check_response.py
src/great_ai/great_ai/views/model.py
src/great_ai/great_ai/views/operators.py
src/great_ai/great_ai/views/query.py
src/great_ai/great_ai/views/sort_by.py
src/great_ai/great_ai/views/trace.py
src/great_ai/open_s3/__init__.py
src/great_ai/open_s3/__main__.py
src/great_ai/open_s3/large_file.py
src/great_ai/open_s3/parse_arguments.py
src/great_ai/open_s3/helper/__init__.py
src/great_ai/open_s3/helper/bytes_to_megabytes.py
src/great_ai/open_s3/helper/human_readable_to_byte.py
src/great_ai/open_s3/helper/progress_bar.py
src/great_ai/utilities/__init__.py
src/great_ai/utilities/clean.py
src/great_ai/utilities/get_sentences.py
src/great_ai/utilities/lemmatize_text.py
src/great_ai/utilities/lemmatize_token.py
src/great_ai/utilities/nlp.py
src/great_ai/utilities/parallel_map.py
src/great_ai/utilities/unique.py
src/great_ai/utilities/data/__init__.py
src/great_ai/utilities/data/american_spellings.py
src/great_ai/utilities/data/punctuations.py
src/great_ai/utilities/evaluate_ranking/__init__.py
src/great_ai/utilities/evaluate_ranking/draw_f1_iso_lines.py
src/great_ai/utilities/evaluate_ranking/evaluate_ranking.py
src/great_ai/utilities/external/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/negspacy/README.md
src/great_ai/utilities/external/negspacy/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/negspacy/negation.py
src/great_ai/utilities/external/negspacy/termsets.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/README.md
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/_util.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/version.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latex2text/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latex2text/__main__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latex2text/_defaultspecs.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/__main__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/_partial_latex_encoder.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/_uni2latexmap.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/_uni2latexmap_xml.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexencode/_unicode_to_latex_encoder.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexwalker/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/latexwalker/_defaultspecs.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/macrospec/__init__.py
src/great_ai/utilities/external/pylatexenc/macrospec/_argparsers.py
src/great_ai/utilities/language/__init__.py
src/great_ai/utilities/language/english_name_of_language.py
src/great_ai/utilities/language/is_english.py
src/great_ai/utilities/language/predict_language.py
src/great_ai/utilities/logger/__init__.py
src/great_ai/utilities/logger/colors.py
src/great_ai/utilities/logger/create_logger.py
src/great_ai/utilities/logger/custom_formatter.py
src/great_ai/utilities/match_names/__init__.py
src/great_ai/utilities/match_names/config.py
src/great_ai/utilities/match_names/match_names.py
src/great_ai/utilities/match_names/name_parts.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/__init__.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/publication_tei.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/__init__.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/affiliation.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/author.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/element.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/publication_metadata.py
src/great_ai/utilities/publication_tei/models/text.py
src/sus.egg-info/PKG-INFO
src/sus.egg-info/SOURCES.txt
src/sus.egg-info/dependency_links.txt
src/sus.egg-info/requires.txt
src/sus.egg-info/top_level.txt
tests/__init__.py
tests/open_s3/__init__.py
tests/open_s3/test_human_readable_to_byte.py
tests/open_s3/test_large_file.py
tests/sus/__init__.py
tests/sus/test_clean.py
tests/sus/test_evaluate_ranking.py
tests/sus/test_get_sentences.py
tests/sus/test_language.py
tests/sus/test_lemmatize_text.py
tests/sus/test_lemmatize_token.py
tests/sus/test_match_names.py
tests/sus/test_parallel_map.py
tests/sus/test_publication_tei.py
tests/sus/test_unique.py
tests/sus/data/10.1136_bmjspcare-2021-003026.pdf.tei.xml
tests/sus/data/bad.tei.xml
tests/sus/data/parsed.py